Le design est primordial en permaculture. Il permet :
- de choisir quels éléments on veut installer dans son système (le jardin ici) : mares, haies, habitations, cultures, serres, forêt-jardin, atelier, compost etc...,
- de mettre en relation les éléments du système entre eux,
- en favorisant les interactions bénéfiques,
- grâce à un positionnement relatif judicieux des éléments, 
- et en fonction de zones nécessitant plus ou moins d'intervention humaine, des secteurs (vent, pluie, soleil), des pentes, etc...

Créer un design un peu élaboré nécessite une formation approfondie ou un accompagnement.